Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PitpnbP53811 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PitpnbP53811 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PitpnbP53811 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms