Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fdft1P53798 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fdft1P53798 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fdft1P53798 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms