Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cux1P53564 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cux1P53564 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux1P53564 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux1P53564 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux1P53564 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux1P53564 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux1P53564 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux1P53564 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cux1P53564 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms