Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold1P52431 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold1P52431 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold1P52431 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pold1P52431 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms