Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a1P51906 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a1P51906 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a1P51906 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms