Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TspoP50637 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TspoP50637 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TspoP50637 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TspoP50637 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TspoP50637 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TspoP50637 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TspoP50637 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TspoP50637 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TspoP50637 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TspoP50637 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TspoP50637 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TspoP50637 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TspoP50637 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TspoP50637 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TspoP50637 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TspoP50637 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TspoP50637 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TspoP50637 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TspoP50637 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TspoP50637 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TspoP50637 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TspoP50637 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TspoP50637 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TspoP50637 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TspoP50637 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TspoP50637 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TspoP50637 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TspoP50637 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TspoP50637 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TspoP50637 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TspoP50637 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TspoP50637 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TspoP50637 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TspoP50637 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TspoP50637 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TspoP50637 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TspoP50637 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms