Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SftpdP50404 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SftpdP50404 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpdP50404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SftpdP50404 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SftpdP50404 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpdP50404 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms