Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl5P50228 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms