Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkn1cP49919 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms