Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfbP49766 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VegfbP49766 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfbP49766 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VegfbP49766 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms