Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HpdP49429 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpdP49429 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpdP49429 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpdP49429 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HpdP49429 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpdP49429 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpdP49429 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpdP49429 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpdP49429 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HpdP49429 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HpdP49429 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpdP49429 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpdP49429 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpdP49429 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpdP49429 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpdP49429 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpdP49429 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpdP49429 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpdP49429 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpdP49429 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpdP49429 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HpdP49429 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpdP49429 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpdP49429 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpdP49429 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HpdP49429 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpdP49429 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HpdP49429 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms