Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Neurod6P48986 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod6P48986 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod6P48986 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms