Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PcntP48725 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcntP48725 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcntP48725 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PcntP48725 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcntP48725 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcntP48725 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PcntP48725 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcntP48725 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcntP48725 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PcntP48725 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcntP48725 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcntP48725 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PcntP48725 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcntP48725 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcntP48725 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcntP48725 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcntP48725 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcntP48725 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcntP48725 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcntP48725 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcntP48725 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PcntP48725 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcntP48725 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcntP48725 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcntP48725 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PcntP48725 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PcntP48725 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcntP48725 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcntP48725 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PcntP48725 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcntP48725 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcntP48725 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcntP48725 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcntP48725 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PcntP48725 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PcntP48725 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcntP48725 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PcntP48725 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcntP48725 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms