Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx2P48379 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx2P48379 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms