Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn3P48299 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edn3P48299 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Edn3P48299 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edn3P48299 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms