Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax9P47242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax9P47242 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms