Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3bP43025 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec3bP43025 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms