Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NodalP43021 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NodalP43021 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NodalP43021 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NodalP43021 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NodalP43021 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NodalP43021 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NodalP43021 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NodalP43021 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NodalP43021 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NodalP43021 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NodalP43021 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NodalP43021 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NodalP43021 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NodalP43021 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NodalP43021 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NodalP43021 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NodalP43021 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NodalP43021 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NodalP43021 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NodalP43021 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NodalP43021 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NodalP43021 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms