Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbP41155 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbP41155 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbP41155 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbP41155 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbP41155 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbP41155 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbP41155 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbP41155 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LtbP41155 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LtbP41155 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LtbP41155 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LtbP41155 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LtbP41155 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LtbP41155 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms