Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VhlP40338 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VhlP40338 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VhlP40338 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VhlP40338 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VhlP40338 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VhlP40338 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VhlP40338 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VhlP40338 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VhlP40338 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VhlP40338 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VhlP40338 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VhlP40338 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VhlP40338 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VhlP40338 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VhlP40338 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VhlP40338 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms