Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn1P35821 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn1P35821 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn1P35821 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn1P35821 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms