Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr2cP34968 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr2cP34968 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htr2cP34968 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr2cP34968 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr2cP34968 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr2cP34968 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr2cP34968 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr2cP34968 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr2cP34968 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms