Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc3P33622 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms