Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa11P31311 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa11P31311 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa11P31311 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms