Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxc10P31257 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc10P31257 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms