Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vcam1P29533 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms