Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp3P28862 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp3P28862 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms