Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RxraP28700 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RxraP28700 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RxraP28700 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RxraP28700 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RxraP28700 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RxraP28700 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RxraP28700 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RxraP28700 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RxraP28700 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RxraP28700 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RxraP28700 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RxraP28700 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RxraP28700 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RxraP28700 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RxraP28700 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RxraP28700 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RxraP28700 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RxraP28700 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RxraP28700 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RxraP28700 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RxraP28700 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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