Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LoxP28301 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LoxP28301 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LoxP28301 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LoxP28301 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LoxP28301 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LoxP28301 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LoxP28301 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LoxP28301 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LoxP28301 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LoxP28301 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LoxP28301 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LoxP28301 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LoxP28301 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LoxP28301 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LoxP28301 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LoxP28301 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LoxP28301 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LoxP28301 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LoxP28301 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LoxP28301 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LoxP28301 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LoxP28301 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LoxP28301 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LoxP28301 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LoxP28301 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LoxP28301 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LoxP28301 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms