Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vav1P27870 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav1P27870 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav1P27870 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms