Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpbP27048 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpbP27048 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpbP27048 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms