Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PdgfraP26618 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfraP26618 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfraP26618 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms