Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou3f1P21952 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms