Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klra1P20937 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klra1P20937 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klra1P20937 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klra1P20937 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klra1P20937 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms