Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntf3P20181 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntf3P20181 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms