Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P20040 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P20040 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P20040 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P20040 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P20040 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P20040 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P20040 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P20040 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P20040 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P20040 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P20040 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P20040 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms