Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PdgfaP20033 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfaP20033 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms