Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csn1s1P19228 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csn1s1P19228 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csn1s1P19228 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms