Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sdc1P18828 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms