Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl9P18340 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcl9P18340 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms