Protein–RNA interactions for Protein: P17047

Lamp2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp2P17047 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp2P17047 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamp2P17047 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp2P17047 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms