Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkceP16054 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkceP16054 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrkceP16054 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms