Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prph2P15499 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prph2P15499 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prph2P15499 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prph2P15499 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prph2P15499 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms