Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn1P12960 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms