Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb1P12658 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calb1P12658 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calb1P12658 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calb1P12658 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calb1P12658 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calb1P12658 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calb1P12658 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms