Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga5P11688 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga5P11688 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga5P11688 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga5P11688 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms