Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamp1P11438 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamp1P11438 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms