Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sub1P11031 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sub1P11031 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms