Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl2P10148 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl2P10148 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms