Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl1P10146 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms